Centre de Ressources Biologiques

Centre de Ressources Biologiques de la Pitié-Salpêtrière

Un centre de Ressources Biologiques (Biobanque) au service de la recherche médicale, au cœur de la recherche, en lien étroit avec les services cliniques de l’hôpital de la Pitié Salpêtrière AP-HP.

Une structuration en 4 filières pour répondre à toutes vos demandes

Dans le respect de l’éthique, de la règlementation et de la qualité

  • Certification qualité depuis 2014 : NFS 96-900. ISO 20 387 depuis avril 2024
  • Traçabilité informatique grâce à des logiciels dédiés (données des échantillons, délai avant congélation et température de stockage)
  • Sûreté des échantillons : accès sécurisé, surveillance 24h/24, 7j/7
  • Exigences réglementaires et juridiques (consentement, confidentialité et anonymisation des données, RGPD) en lien avec l’URC, le service juridique et la DRCI

Préparation des kits de prélèvement

Prise en charge du technicage des prélèvements, notre savoir-faire :

  • Préparation sérum, plasma, urines, salive, liquide céphalo rachidien, PBMC…
  • Préparation des tissus à partir de pièces fraiches (tumeur, biopsie, pièce opératoire)
  • Préparation d’acides nucléiques
  • Technicage à façon

Etudes Cliniques

A toutes les phases de vos études, nous vous accompagnons sur la mise en place du circuit de l’échantillon : du prélèvement à l’envoi et prenons en charge le technicage des prélèvements et des produits dérivés (cellules, ADN, ARN).

Nos plus-values

  • Savoir faire
  • Traçabilité
  • Certification Qualité
  • Réactivité, adaptabilité
  • Aide à la rédaction des documents

Cohortes

Plus précisément de nos jours, en santé, une cohorte consiste à suivre dans le temps une population recouvrant des caractéristiques communes, en collectant des données et/ou des échantillons biologiques.

Nous vous accompagnons sur la mise en place des cohortes en vous assurant la pérennité d’une structure institutionnelle et en permettant la visibilité de vos collections qui assure leur valorisation.

Les ressources biologiques hébergées au CRB-PSL reflètent les pathologies phares de l’hôpital de la Pitié-Salpêtrière. Elles représentent plus de 240 000 échantillons avec leurs données associées, issus du soin, des essais cliniques ou des cohortes.

Pour avoir accès aux ressources biologiques :

  1. Analyse du projet par un conseil scientifique (adresser une demande au CRB)
  2. Réception d’un avis 
  3. Mise en place du contrat et des démarches réglementaires
  4. Transmission des données associées
  5. Organisation et expédition des échantillons

Quelques exemples de collaborations

Quelques publications

Gaborit, B., Fernandes, S., Loubet, P., Ninove, L., Dutour, A., Cariou, B., Coupaye, M., Clement, K., Czernichow, S., Carette, C., Resseguier, N., Esterle, L., Kali, S., Houssays, M., de Lamballerie, X., Wittkop, L., Launay, O., Laville, M., & ANRS0001S COV-POPART study group (2023). Early humoral response to COVID-19 vaccination in patients living with obesity and diabetes in France. The COVPOP OBEDIAB study with results from the ANRS0001S COV-POPART cohort. Metabolism: clinical and experimental, 142, 155412. https://doi.org/10.1016/j.metabol.2023.155412

Matuozzo, D., Talouarn, E., Marchal, A., Zhang, P., Manry, J., Seeleuthner, Y., Zhang, Y., Bolze, A., Chaldebas, M., Milisavljevic, B., Gervais, A., Bastard, P., Asano, T., Bizien, L., Barzaghi, F., Abolhassani, H., Abou Tayoun, A., Aiuti, A., Alavi Darazam, I., Allende, L. M., … Cobat, A. (2023). Rare predicted loss-of-function variants of type I IFN immunity genes are associated with life-threatening COVID-19. Genome medicine, 15(1), 22. https://doi.org/10.1186/s13073-023-01173-8

Loubet, P., Wittkop, L., Ninove, L., Chalouni, M., Barrou, B., Blay, J. Y., Hourmant, M., Thouvenot, E., Laville, M., Laviolle, B., Lelievre, J. D., Morel, J., Quoc, S. N., Spano, J. P., Terrier, B., Thiebaut, A., Viallard, J. F., Vrtovsnik, F., Circosta, S., Esterle, L., … ANRS0001S COV-POPART study group (2023). One-month humoral response following two or three doses of messenger RNA coronavirus disease 2019 vaccines as primary vaccination in specific populations in France: first results from the Agence Nationale Recherche contre le Sida (ANRS)0001S COV-POPART cohort. Clinical microbiology and infection : the official publication of the European Society of Clinical Microbiology and Infectious Diseases, 29(3), 388.e1–388.e8. https://doi.org/10.1016/j.cmi.2022.10.009

Migliozzi, S., Oh, Y. T., Hasanain, M., Garofano, L., D’Angelo, F., Najac, R. D., Picca, A., Bielle, F., Di Stefano, A. L., Lerond, J., Sarkaria, J. N., Ceccarelli, M., Sanson, M., Lasorella, A., & Iavarone, A. (2023). Integrative multi-omics networks identify PKCδ and DNA-PK as master kinases of glioblastoma subtypes and guide targeted cancer therapy. Nature cancer, 4(2), 181–202. https://doi.org/10.1038/s43018-022-00510-x

Ko, A., Hasanain, M., Oh, Y. T., D’Angelo, F., Sommer, D., Frangaj, B., Tran, S., Bielle, F., Pollo, B., Paterra, R., Mokhtari, K., Soni, R. K., Peyre, M., Eoli, M., Papi, L., Kalamarides, M., Sanson, M., Iavarone, A., & Lasorella, A. (2023). LZTR1 Mutation Mediates Oncogenesis through Stabilization of EGFR and AXL. Cancer discovery, 13(3), 702–723. https://doi.org/10.1158/2159-8290.CD-22-0376

Hoogstrate, Y., Draaisma, K., Ghisai, S. A., van Hijfte, L., Barin, N., de Heer, I., Coppieters, W., van den Bosch, T. P. P., Bolleboom, A., Gao, Z., Vincent, A. J. P. E., Karim, L., Deckers, M., Taphoorn, M. J. B., Kerkhof, M., Weyerbrock, A., Sanson, M., Hoeben, A., Lukacova, S., Lombardi, G., … French, P. J. (2023). Transcriptome analysis reveals tumor microenvironment changes in glioblastoma. Cancer cell, 41(4), 678–692.e7. https://doi.org/10.1016/j.ccell.2023.02.019

Hernández-Verdin, I., Kirasic, E., Wienand, K., Mokhtari, K., Eimer, S., Loiseau, H., Rousseau, A., Paillassa, J., Ahle, G., Lerintiu, F., Uro-Coste, E., Oberic, L., Figarella-Branger, D., Chinot, O., Gauchotte, G., Taillandier, L., Marolleau, J. P., Polivka, M., Adam, C., Ursu, R., … Alentorn, A. (2023). Molecular and clinical diversity in primary central nervous system lymphoma. Annals of oncology : official journal of the European Society for Medical Oncology, 34(2), 186–199. https://doi.org/10.1016/j.annonc.2022.11.002

Nous vous remercions d’avoir accepté de donner vos prélèvements pour nous aider à améliorer les traitements et à développer la médecine personnalisée.

A réception au Centre de Ressources Biologiques, vos prélèvements sont pseudonymisés afin de ne pas pouvoir remonter à votre identité, lors de l’utilisation de vos échantillons pour la recherche médicale.

Votre don est libre et volontaire. Vous pouvez à tout moment exercer votre droit de retrait sans justification, en précisant le nom de l’étude, et vos coordonnées pour vous recontacter, au :

A votre demande, vos échantillons seront détruits.

Vous trouverez ci-dessous la liste des projets utilisant les ressources biologiques des différentes collections

Onconeuroteck

Titre de l’étude Objectifs Année de lancement État d’avancement Promoteur Contact
GLIOTUB

Le glioblastome est la tumeur cérébrale la plus fréquente et la plus agressive chez l’adulte, notamment du fait de l’infiltration des cellules tumorales dans le cerveau et de la résistance à la chimiothérapie et radiothérapie.

Ce projet de recherche vise à étudier un mécanisme moléculaire potentiellement impliqué dans la résistance des cellules tumorales à la radiothérapie et dans la capacité des cellules tumorales d’envahir le cerveau. Ce mécanisme régule le cytosquelette, c’est-à-dire « squelette » qui donne à la cellule tumorale sa résistance et lui permet de se déplacer. L’étude d’échantillons tumoraux permettra de mieux corréler ce mécanisme avec l’évolution de chaque tumeur. 2025 En cours Académique (ICM, Paris, France) franck.bielle@aphp.fr
Methyl-SU

L’analyse du méthylome est une méthode permettant de classer les tumeurs cérébrales. De nouveaux types de tumeurs peuvent ainsi être reconnus et être associés à un pronostic et à une réponse à un traitement.

Le projet vise à développer une base de données de référence de méthylome des tumeurs cérébrales et à utiliser cette base pour aider au diagnostic plus précis et plus rapide (pendant l’intervention chirurgicale) des tumeurs cérébrales et pour faciliter la recherche sur des types de tumeurs mieux définis. 2025 En cours Académique (ICM, Paris, France) franck.bielle@aphp.fr
ANAMEN

Rôle pronostique de l’étendue de la résection et de la radiothérapie adjuvante dans les méningiomes anaplasiques de novo

L’objectif est de déterminer le rôle pronostic sur la récidive et la survie globale de différents niveaux de résection chirurgicale et de la radiothérapie post-opératoire systématique dans le sous-groupe particulier des méningiomes de Grade 3 de novo. 2024 Publiée PubMed Académique (ICM, Paris, France) matthieu.peyre@aphp.fr
Longit-GBM
Reconstruction phylogénétique cellulaire et modélisation de l’évolution par single cell whole genome sequencing de paires de glioblastome (initial et récidive post traitement)
Une analyse phylogénétique de la trajectoire des glioblastomes sous traitement n’a jamais été réalisée avec un tel degré de granularité (cellules uniques). Ces données permettront de mieux comprendre les altérations génétiques directement liées à des mécanismes de résistance. 2024 En cours Académique (Université Miami, USA) marc.sanson@aphp.fr
I BRAIN

Vaincre l’immunorésistance des glioblastomes

Malgré des avancées importantes dans l’immunothérapie des cancers, les gliomes de hauts grades restent majoritairement résistants aux traitements actuellement disponibles. Le but est d’étudier l’influence du microenvironnement immunitaire particulier des gliomes sur la résistance aux immunothérapies. 2024 En cours Académique (ICM, Paris, France) mehdi.touat@aphp.fr
astro-ATRXm

Etude histomoléculaires des astrocytomes IDH mutés ATRX maintenu

La biologie et le pronostic des tumeurs du sous-groupe des astrocytomes IDH mutés sont mal connus : des mécanismes variables de maintien des télomères peuvent être observés comme une mutation du promoteur de TERT et une activation de la voie ALT sans perte d’expression d’ATRX en immunohistochimie. Le projet vise à caractériser les tumeurs de ce sous-groupe sur le plan clinique, histologique et moléculaire afin de mieux guider leur prise en charge. 2024 En cours Académique (CHU Lyon, France) franck.bielle@aphp.fr
PNC-snSEQ

Identification des états cellulaires et des mécanismes d’activation dans les gliomes à composante neuronale primitive par séquençage unicellulaire

Identifier, à partir de l’analyse transcriptomique unicellulaire (snRNAseq), les états cellulaires et les marqueurs moléculaires associés au développement d’une composante neuronale primitive dans certains gliomes 2024 En cours Académique et Industrielle (ICM, Paris, France – One Biosciences) mehdi.touat@aphp.fr
CCNU resist

Mécanismes de résistance au CCNU (lomustine) dans les gliomes de haut grade

Déterminer les mécanismes de résistance aux CCNU dans les gliomes de haut grade, en analysant les différences transcriptomiques et génomiques entre des tumeurs avant et après traitement par CCNU 2024 En cours Académique (ICM, Paris, France) mehdi.touat@aphp.fr
ASAH2gain

Etude de l’effet métabolique du gain du gène ASAH2 dans les gliomes IDH-mutés

Des modifications du métabolisme cellulaire sont associées à la transformation tumorale. Elles peuvent contribuer à l’agressivité tumorale. Une meilleure compréhension de ces modifications et en particulier des mécanismes enzymatiques sous-jacents peut ouvrir des perspectives thérapeutiques. Ce projet s’intéresse au métabolisme lipidique des cellules tumorales de gliomes diffus IDH muté pour comprendre sa contribution à la transformation tumorale et identifier une éventuelle vulnérabilité utilisable à des fins thérapeutiques. 2023 En cours Académique (Université Miami, USA) franck.bielle@aphp.fr
BRAF & Microglie

Etude de l’état d’activation microgliale associée aux tumeurs gliales ou glioneuronales avec mutation BRAF V600E

Les immunothérapies restent peu efficaces contre les gliomes (tumeurs cérébrales primitives gliales). Notre équipe a montré que les gliomes avec mutation du gène BRAF ont une proportion augmentée en lymphocytes, ces cellules immunitaires impliqués dans la réponse immunitaire contre les tumeurs. Nous cherchons à mieux comprendre les mécanismes de cette infiltration lymphocytaire qui pourraient être exploités à des fins thérapeutiques en améliorant l’efficacité des immunothérapies. 2023 En cours Académique (ICM, Paris, France) franck.bielle@aphp.fr
EXOLIGO

Culture et conservation d’explants d’oligodendrogliomes

Les oligodendrogliomes sont difficiles à étudier car il existe peu de modèles in vitro qui récapitulent la biologie de ces tumeurs. Notre projet vise à établir et à caractériser un modèle dans lequel des petits fragments (appelés explants) de tumeurs sont cultivés dans des boites de pétri et maintenus pendant plusieurs semaines en culture. Ce système permet de maintenir l’architecture cellulaire de la tumeur et de tester les effets de différents médicaments sur les cellules tumorales et les cellules du microenvironnement. 2023 En cours Académique (CHU Lyon, Institut Curie, CHU Marseille) emmanuelle.huilllard@icm-institute.org
PROGLIO

Caractérisation protéomique des oligodendrogliomes agressifs

Les oligodendrogliomes sont différents d’un patient à l’autre. Il existe un sous-groupe d’oligodendrogliomes plus agressif, pour lequel nous n’avons pas de traitements. Notre étude permet d’analyser finement les différents sous-groupes d’oligodendrogliomes afin de trouver et tester des médicaments qui pourraient être proposés pour les formes agressives d’oligodendrogliomes. 2020 En cours Académique (CHU Lyon, Institut Curie, CHU Marseille) emmanuelle.huilllard@icm-institute.org

Centre de Ressources Biologiques de la Pitié-Salpêtrière (CRB PSL)
AP-HP.Sorbonne Université
Hôpital La Pitié-Salpêtrière
Plateforme de Ressources Biologiques – Bât Roger Baillet
47/83 Bd de l’Hôpital
75013 PARIS

Email : crb.psl@aphp.fr